Subséries em Repressão (R)
Estrutura (E)
A subsérie Estrutura (E) é composta por três dossiês: Serviço Nacional de Informações (SNI); Segurança Nacional (SN) e Justiça militar (JM). Trata-se de documentos sobre a Doutrina de Segurança Nacional, do Conselho de Segurança Nacional, das leis de Segurança Nacional, além de órgãos de inteligência e decisões do Superior Tribunal Militar.
Grupos armados (GA)
A subsérie Grupos armados (GA) possui três dossiês: Guerrilha urbana (GU); Caso Chandler (CC) e Grupos de extrema-direita (ED). Refere-se a ações armadas ocorridas durante a ditadura, tanto de grupos de resistência à ditadura, quanto de grupos de extrema-direita atuantes no período. Destaque para o caso do assassinato do capitão americano Charles Chandler.
Violações de direitos humanos (VDH)
A subsérie Violações de direitos humanos (VDH) contém seis dossiês: Suspensão e perda de direitos políticos (DP); Prisões arbitrárias e presos políticos (PP); Mortos e desaparecidos (MD) e Tortura (T). Trata-se de documentos sobre diversas violações de direitos humanos praticadas por agentes de segurança ao longo da ditadura militar, como torturas, prisões arbitrárias, desaparecimentos forçados e outros.